當進行食品工廠設計時，其設計原則應密切結合生產工藝的流程、生產特點和特殊要求來進行。
在做食品工廠設計時，不僅要以工藝流程為主要依據考慮第一樓層各工段的水平聯系，還要考慮各層間垂直方向聯系的順序。從簡化后的工藝流程來看，其流程可分為自上而下和自下而上。前一種是先將原料或半成品運至頂層，然后按順序逐層下降，最后在底層裝配或完成最后一道加工工序，如面粉廠、奶粉廠。這一類靠加工對象自重逐層向下完成各道加工工序的生產比較合適；后一種恰好相反，最后工序在頂層完成。
實際上不少工廠的生產不如上述簡單或自上而下一次仍未完成，還帶提升到頂層再自上而下繼續加工才能全部完成，如前面所列舉的面粉廠。
由此可見，食品工廠設計時應結合工藝流程特點和具體情況，既要使各層工段的面積分配合理，流程通順而簡捷，又要使垂直運輸樞紐的布置經濟合理。
多層廠房的底層應布置什么工段或車間，不一定是頭道或末道工序，應根據工藝特點確定。往往有些工段因某些要求，如地面荷載較大，運輸量較大，用水較多，地面經常有腐蝕性污水等，最好布置在底層。這些工段面積的大小，它們在整個工藝流程中所處的先后順序等因素常直接影響工藝流程的安排，進而影響其他工段的位置。如果要求放在底層的工段所需面積不大，生產過程運輸量也不大，工藝流程可不受其位置的影響，即流程可從底層開始，逐層上升，直到頂層完成整個生產過程；或全部自上而下，或自下而上的流程中只有部分加工需從上層下到底層，有局部往返過程。設計時應力求使上述要求布置在底層的工段和與其有關聯的工段之間保持方便的垂直或水平聯系。如果要求布置在底層的工段面積較大或運輸量較大，就需要根據工段在整個工藝流程中所處順序來確定流程布置。有時候，工段在流程的中間，流程順序又較嚴格，則可采用反復流程的方案。
此外，食品工廠設計實踐中常遇到一些工段，根據生產特點要求獨立布置與其他工段有較嚴格的區分，但流程上還能保留一定聯系。當車間平面為一字形而這種工段面積又不大時，常將它們布置在廠房兩端，以樓梯間將它們和其他工段分開。這樣，這些工段既可便于組織獨立的工作環境，又可和同層的其他工段取得較方便的聯系。
食品廠中某些工段對防塵、防震、恒溫要求較高，而一般輔助用房或前處理加工不需要恒溫，有時相反還可能產生大的振動，直接干擾防震工段的生產，因而布置平面時應將防震、防塵、恒溫要求高的工段和其他工段分區相對集中，不僅可減少互相干擾，而且可節約空調設備、土建投資和運行管理費用。
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