對于藥廠設計來說，在生物制藥工廠的廠區中，除生產上需要各種管線外，藥廠廠區還有給水管線、電力電纜線等工程管線，由此構成了廠內龐大復雜的管網系統。管線系統的布置情況對藥品生產的影響較大，合理的管線布置有利于企業的正常生產與管理。下面筆者就談下藥廠設計之廠區管線布置。
藥廠廠區內各建筑物、構筑物內所需要的各種工程管線應在總體布置時綜合考慮。應盡量使管線間與建筑物之間在平面和立面上相互協調。要考慮方便使用、施工、檢修及安全生產的要求。埋設于地下的管線，成本較高，但有利于生物制藥工廠的環境。藥廠潔凈生產廠房布置于地面上的管線成本較低且便于施工和檢修，對多數場合比較合適。
一、藥廠設計之地上管線布置原則
a.管線宜直線敷設，宜與道路、建筑物的軸線相平行或垂直，干管應布置在主要用戶及支管較多的一邊。
b.多種管道可集中布置，水平或垂直排列。盡量減少管線間以及管線與道路的交叉，當交叉時，一般宜成直角交叉。
c.管線敷設應該避開露天堆場及建筑擴建用地。
d.架空管線跨越道路時，離地面應有足夠的垂直凈距，不能影響人行和運輸，如為Ⅱ形彎曲恰好兼有熱補償作用。
e.引入廠內的高壓電線，應盡可能沿廠內邊緣布置并盡量減少長度。
f.可燃氣體、液體管道不得穿越可燃材料的結構和可燃、易燃材料堆場。
g.管線綜合布置發生矛盾時，一般應臨時讓永久、管徑小的讓管徑大的、可彎曲的讓不可彎曲的、有壓力的讓自流的、施工量小的讓施工量大的、新的讓原有的。
二、藥廠設計之地下管線布置原則
a.根據各種管線不同地埋深度，由建筑物基礎外緣至道路中心由淺入深地依次布置。一般情況下按照弱電電纜、管溝、給水管、雨水管、污水管的順序布置。
b.將檢修次數較少的雨水管、污水管埋設在道路下面。
c.小管讓大管，壓力管讓重力管，軟管讓硬管，短時管讓永久管。
d.電力電纜不應與直埋的熱力管道平行，遇交叉時，電纜應在下方穿過或采取保護措施。
e.能散發可燃氣體的管線，應避免靠近通行管溝和地下室。
f.大管徑壓力較高的給水管應避免靠近建筑物。
g.地下管線埋設應留有適當余地，以備工廠發展需要。