潔凈室中的操作人員被認為是潔凈室中最大的污染來源。人的外層皮膚不斷地向周圍環境釋放粒子，是因為外層皮膚細胞連續不斷地被其下的新細胞所替換。而服裝與首飾等的摩擦，也會增加外層皮膚釋放的粒子數量。由于工作時，人員會有更多的活動，所以釋放的粒子數量也會相應增加。所以對于在潔凈室中的操作人員應進行嚴格的管理，下面成都凈化工程公司就談下藥廠潔凈室工程之人員微生物控制。
①潔凈區內的人數應當嚴加控制，檢查和監督應當盡可能在無菌生產的潔凈區外進行。
②進入潔凈室人員的登記制度。登記進入潔凈室的人員數量和時間。
③人員出入的規定。人員進入潔凈室前，應將拖鞋在粘塵墊上擦拭。如果在潔凈室入口處有空氣吹淋室，那么人員一定要通過吹淋室；人員進入潔凈室后，必須根據需要進行洗手、消毒、換工作服。進入潔凈室人員必須遵循規定的凈化路線和程序，不能私自改變。如果潔凈室的人員需要上潔凈室外的廁所時，必須按照出入潔凈室的程序處理，絕對不允許穿潔凈服上廁所。人員離開潔凈室同樣應按照規定的程序洗滌、更衣、換鞋，潔凈服不得帶出潔凈區。
④潔凈室人員的教育培訓。對潔凈室工作人員和技術人員進行教育培訓應該掌握的內容包括:潔凈室內的產品所要求的潔凈度；潔凈室污染源及其控制；工藝操作對潔凈度的影響；潔凈室、產品、工作服的潔凈度測定方法；凈化設備和系統的使用規程，故障排除方法；本潔凈室的構造和性能；安全措施；測定方法和評價方法的細則。
⑤潔凈室工作人員的訓練。對潔凈室工作人員進行訓練，主要內容包括:按照規定的方法練習脫去個人服裝；按規定的方法練習穿潔凈服；按規定的方法練習洗手、烘干、使用潔凈室專用紙；做不拖足走路練習；做帶進潔凈室去皮的清潔消毒練習；練習使用潔凈室的消防器材；做潔凈室內緊急疏散的練習。
⑥對潔凈室工作人員的特殊培訓。特殊培訓的內容主要是對潔凈室的認識，包括:有關微生物、顆粒等的初步知識；有關潔凈室及菌落數含義的基本知識；潔凈空調系統的運行管理及基本概念；為維持及保證室內潔凈度應采取的措施。
⑦對潔凈室操作人員衛生的要求。每一個人員應該對自己個人的清潔衛生負責；對于高級別的無菌潔凈室，進入前應進行淋浴、更衣；包括胡須在內的所有毛發，都應該全部遮住，并且要注意手衛生，尤其是指甲、指甲根部的衛生。
⑧從事動物組織加工處理的人員或者從事與當前生產無關的微生物培養的工作人員通常不得進入無菌藥品生產區，不可避免，應當嚴格執行相關的人員凈化操作規程。