對于成都潔凈室設計來說，空調機房最好靠近要求送風量大的潔凈室，力求風管路短但從防止噪聲和振動來說又要求把機房和潔凈室隔開。這兩方面都應予以考慮隔開方式有：
一、構造分離方式可分成以下幾種：
①沉降縫隔開式：使沉降縫在潔凈室與機房之間過起分隔作用
②夾壁墻隔開式：如果機房緊靠潔凈室，不是公用一面墻，而是各自有各自的隔墻，兩面隔墻之間留有一定寬度的夾縫。
③輔助室隔開式：在潔凈室與機房之設輔助室，起緩沖作用
二、分散方式。分以下幾種：
①屋面上或吊頂上分散式：現在常有把機房設在最上層屋面上的做法，使之遠離下面的潔凈室，但屋面下一層最好設為輔助或管理層，或者作為技術夾層
②地面下分散式：把機房設于地下室。
三、獨立建筑方式。在潔凈室建筑之外單獨建立機房，但其離潔凈室最好很近
既使采用上述隔開方式，仍然要注意機房的防水、隔振和隔聲問題。
機房地面應全部做防水處理，并有排水措施，特別是對于上層機房
為了隔振，應在振源的風機、電機等的支架、底座作防振處理，甚至必須把設備安在混凝土板塊上再用防振材料支撐該板塊，該板塊的重量應為設備總重量的1~3倍。
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