手術室屬于生物潔凈室，不同類型的手術需要的潔凈度是不同的，一般來說，手術室主要分為以下幾個等級。
1、一級 特別潔凈手術室 級別100
2、二級 標準手術室 級別 1000到10000
3、三級 一般潔凈手術室 級別10萬
4、四級 準潔凈手術室和輔助用房 級別30萬
100級 (特別潔凈) 手術室主要用于瓣膜置換、心臟手術、器官移植、人工關節置換、神經外科。
1000級(標準潔凈)主要用于： 眼外科、整形外科、非全身燒傷、骨科、普外科中的I類手術、肝膽胰外科、體外循環灌注準備室。
10000級(一般潔凈)主要用于： 胸外科、泌尿外科、婦產科、耳鼻咽喉科、普外科(除去I類手術) 手術間、無菌室。
100000級(一般潔凈)主要用于： 門診、急診、感染手術、全身燒傷、走廊、洗手間、麻醉預備室。
從上面我們可以看出，不同的手術類型需要不同潔凈度的手術室，那么手術室潔凈度的不同也就意味著手術室的凈化空調系統也是不同的，下面筆者就談下手術室選擇凈化空調系統的要點。
醫院新建潔凈手術部的凈化空調設計，屬生物潔凈室，被操作對象是需手術的病人，操作人員是醫護人員。每間手術室醫護人員的數量一般為6~12人，醫護人員在手術床的兩側進行手術。若病人患有傳染病，手術過程中容易發生傳染病毒的傳播，這些因素在設計前均應考慮到。手術室若為新建建筑，所有設備管道的布置空間不受限制。通過對上述條件及各種系統特點的分析，取長補短，再結合醫院潔凈手術部建筑技術規范的規定，就可得出該凈化空調系統應選用集中供給新風的分散式系統。如果設有傳染病手術室，應將其設計成獨立的正負壓切換的手術室。
在上述系統選擇時，主要矛盾是使潔凈手術部始終處于受控狀態，始終處于潔凈無菌的狀態，且運行靈活。不能因為某間潔凈手術室停開而影響整個手術部的壓力梯度分布，破壞各房間之間的正壓氣流的定向流動，引起交叉污染。從這個角度分析，似乎應選用集中式系統。但潔凈手術部內有不同級別的手術室及潔凈輔助間，集中式系統只能有一個送風狀態點，這樣，不同級別的手術室由于送風量的不同而使有的手術室“過冷或過熱”，影響手術環境的舒適度。在手術室內有時給傳染病人做手術，采用集中式系統很容易形成交叉污染，除非是集中直流式（全排式）系統，但這種方案因能耗太大而又不可能采用。而潔凈手術室應運行靈活，不能在非手術期間，也運行凈化空調系統，這樣能耗太大。可見，采用單純的集中式系統，未能很好地解決手術部的主要矛盾。為了手術室的靈活運行，似乎應采用分散式系統，但分散式系統具有壓力不容易控制的缺點。這樣，當某間手術室停用時，很容易使正壓氣流的流向改變，形成交叉污染。所以，不能選用純分散式系統。通過對各系統的優缺點進行比較后發現，只有把集中式系統與分散式系統有機地結合起來，才能很好地解決手術室的主要矛盾。也就是選用集中供給新風的分散式系統，使每個系統中手術室的凈化空調和維持正壓兩大功能分離，又能將整個潔凈手術部聯系在一起。在手術部全部手術室工作期間，兩個系統同時運行；在手術部只有部分手術室工作期間，只需運行該部分手術室的獨立凈化空調機組和正壓送風系統（集中新風系統），既保證部分手術室正常工作，又保證整個手術部的正常壓力分布和空氣定向流動。在手術部非工作期間，只運行正壓送風系統，維持整個手術部正壓，此時，可降低手術部溫、濕度要求，保持其潔凈無菌狀態，節能效果顯著。
系統形式確定后，至于每臺空氣處理機組負擔幾間手術室，由規范的規定確定。如、Ⅱ級潔凈手術室應每間手術室采用獨立的凈化空調系統，Ⅲ、Ⅳ級潔凈手術室可2~3間合用一個系統，潔凈手術室應與輔助用房分開設置凈化空調系統。對于傳染病人用的手術室，采用單獨的直排式系統，并保持相對負壓，若設計成正、負壓可切換式，可提高手術室的利用率。給傳染病人做手術時用負壓直排式，給非傳染病人做手術時切換成正壓手術室。
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