在藥廠設計中，可以把凈化空調系統按照潔凈室氣流流型進行分類，按照潔凈室氣流流型，可將空調凈化系統劃分為三種：單向流潔凈室、非單向流潔凈室、混合流潔凈室。
一、單向流潔凈室
單向流潔凈室是氣流以均勻的截面速度，沿著平行流線以單一方向在整個室截面上通過的潔凈室，適用于 A 級潔凈室（區），有垂直單向流（見圖1)和水平單向流（見圖2)兩種。
圖1
圖2
圖3
在進行藥廠設計時，兩種單向流均依賴于末端過濾器的送風與回風口接近一對一的相對設置，以盡可能保持氣流呈直線。這兩種單向流均能夠保證工藝核心區氣流受到的干擾最小。單向流通過活塞和擠壓原理，把灰塵從一端向另一端擠壓出去，用潔凈氣流置換污染氣流。與潔凈氣流相垂直的工作面上的各個位置都具有相同的潔凈度。
在動態狀態下，單向流下的人員操作和設備的阻礙會使單向流變為亂流，但是如果采用0.36?0.54m/s 的風速會使被打亂的單向氣流得以迅速恢復從而保證該區域的潔凈度。
圖1中的（a）顯示的是一個空氣流經整個地板的垂直單向流，該方式需將潔凈室地面設置為格柵地板，其建造成本和后期的維護比較高。
圖1中的（b）顯示的是一個將回風格柵安裝在房間兩側底部墻角的垂直單向流，這種設計適用于面積不大的潔凈室，主要原因為面積過大后潔凈室中心以及底部的單向流效果不好。
圖2顯示的是一個典型的水平單向流潔凈室設計。通常情況下潔凈室墻的面積要小于天花板的面積，因此水平單向流潔凈室的初期建造費用要低于垂直單向流潔凈室。
與圖3對比可以看出，水平單向流在動態條件下操作人員后方的區域均為被污染的區域，比垂直單向流的污染面積要大得多，因此水平單向流在制藥行業中不常被采用。
從上述工作原理和分析對比可以看出，單向流潔凈室可以快速地將潔凈室內的污染排除，并能有效地控制微粒和微生物的擴散，對于藥廠設計來說，制藥行業中常采用單向流氣流組織來設計 A 級潔凈室（區）。單向流潔凈室因為在送風面上滿布高效過濾器，所以在初期的建造投資以及后期的運行維護成本上都比較高。
二、非單向流潔凈室
非單向流潔凈室是氣流以不均勻的速度呈不平行流動，伴有回流風、或渦流的潔凈室，也稱
紊流或亂流潔凈室（見圖4）。空氣經分布于送風面上的多個過濾器風口送入，并在較遠的
位置回風。過濾器風口可在整個潔凈室或潔凈區等距離分布，也可成組設于工藝核心區上方。過濾器出風口的位置對于潔凈室的性能非常重要。盡管非單向流潔凈室中的冋風位置不像單向流那么重要，但為了盡量減少潔凈室中的死區，也應注意回風口的布局。
在藥廠設計中，非單向流采用稀釋原理，即“臟”的房間空氣與“干凈“的房間空氣不斷地混合，以降低房間內空氣中的微粒負荷。一般形式為高效過濾器送風口頂部送風，回風的形式有下部回風機側下部回風和頂部回風等。依不同送風換氣次數，實現不同的凈化級別，其初期投資和運行費用也不同。
圖4
該類型潔凈室最大的優點為建造和運行成本都非常低，其缺點為室內空氣的潔凈度通常達不到高等級（A 級）的要求。
三、混合流潔凈室
在藥廠設計中，混合流潔凈室是在同一房間內綜合利用單向流和非單向流兩種氣流方式的潔凈室（見圖5）。這種潔凈室的特點是將垂直單向流面積壓縮到最小，用大而積非單向流替代大面積單向流，這樣既節省初期投資和后期運行費用，又能為關鍵的操作區域提供高等級的潔凈度，因此在制藥行業中得到了廣泛的應用。
圖5